[NMusers] Post-doctoral position on population PK at CEA Saclay (France, Paris region) to model human drug metabolism

Dear colleagues,

Please find below the description (in French and English) of a 2 year
post-doctoral position in our laboratory focusing on population
pharmacokinetic modelling of drug metabolism.

Do not hesitate to contact me for further information.

Best regards,

Etienne Thevenot.



# Français
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Post-doctorat au CEA-Saclay : Mathématiques appliquées à la modélisation
de la pharmacocinétique et du métabolisme des médicaments chez l'homme

I. Poste à pourvoir

Contexte du projet
Le CEA (http://www.cea.fr/) est un organisme pluridisciplinaire à
vocation principalement technologique dont l'un des axes forts porte sur
les technologies de l'information et de la santé.
Le projet s'inscrit dans le programme transverse "technosanté" du CEA.
Il regroupe plusieurs laboratoires appartenant à la direction des
sciences du vivant (pour les aspects biologie et pharmacologie) et à la
direction de la recherche technologique (pour la modélisation statistique).
La connaissance du métabolisme des médicaments chez un individu est un
élément majeur pour prédire leur efficacité thérapeutique et leur
toxicité. Aussi l'évaluation de l'activité des enzymes clés du
métabolisme au moyen d'un test simple chez le patient (i.e. la
caractérisation de son phénotype) permettrait un ajustement fin de la
posologie.
Pour réaliser un tel phénotypage, l'approche choisie consiste chez un
patient à administrer un cocktail de molécules de référence, puis à
doser chez ce patient la pharmacocinétique des substrats et des
métabolites par spectrométrie de masse afin, in fine, de modéliser les
activités des enzymes du métabolisme de manière personnalisée.

Sujet proposé
Au sein de notre laboratoire, le projet confié au (à la)
post-doctorant(e) consistera à développer un module logiciel de
traitement, d’analyse et d’exploitation des données à partir des dosages
mesurés et/ou issus de la littérature (substrats et métabolites) ainsi
que de plusieurs co-variables. Dans un premier temps, le travail
d’analyse des données et de modélisation statistique (par exemple en
langage R ou C++) portera sur les résultats expérimentaux obtenus in
vitro et in vivo afin de valider la faisabilité de la méthode. Dans un
deuxième temps, le (la) post-doctorant(e) participera au dimensionnement
de l'étude clinique destinée à recueillir la base de données chez
l'homme. L'objectif final est de prédire, à partir d'un simple
prélèvement chez un patient :
1. les activités enzymatiques de ce patient
2. la posologie optimale d'un nouveau médicament que le médecin souhaite
lui administrer.

Profil recherché
Nous recherchons un(e) candidat(e) ayant effectué son doctorat en
mathématiques appliquées (statistiques, optimisation) et très motivé(e)
par l'analyse des données de l'expérimentation biologique, en vue d'une
application clinique.
Nature du contrat de travail : CDD
Type de contrat de travail : Droit privé
Durée du contrat : 2 ans (1 an renouvelable 1 fois)
Salaire : environ 2700 € brut/mois

Note
Les candidats sont invités à vérifier qu'ils remplissent tous les
critères requis pour les post-doctorats dont le CEA est employeur
(http://www-instn.cea.fr/rubrique.php3?id_rubrique=68).

II. Modalité de dépôt de candidature
Merci d'envoyer le CV détaillant l'expérience acquise et incluant la
liste des publications, ainsi que la lettre de motivation, à :
Etienne Thévenot
+33 (0) 1 69 08 79 23
etienne.thevenot_at_cea.fr
Laboratoire Modélisation, Mesure et Analyse
Commissariat à l'Energie Atomique, LIST/DETECS/SSTM, 91191
Gif-sur-Yvette cedex, France



# English:
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Post-doctoral position at CEA Saclay (France, Paris region): Applied
mathematics to pharmacokinetic data statistics and prediction of drug
metabolism in human

Background:
Health and information technologies are a major focus of the CEA
(http://www.cea.fr/english_portal), as a prominent player in European
technological research (http://www.cea.fr/english_portal). Mathematics,
life sciences and computing are part of the interdisciplinary scientific
expertise at the Saclay research centre (5,000 researchers and
collaborators).
The Department of Sensor and Signal Processing
(http://www-list.cea.fr/gb/index_gb.htm) focuses on the design of new
sensors, the development of intelligent associated instrumentation, and
the development of high-performance hardware and software architectures
to process large volumes of data in real time.

Project:
Drug metabolism in the human body is of major importance for assessing
therapeutic effects and toxicity. Determining the activities of the key
enzymes of a patient (i.e. its phenotype) with a simple test would
therefore be of great value for drug dosage.
In collaboration with the Department of Medical Research, the project
aims at 1) measuring the substrates and metabolites amounts by mass
spectrometry after administration of a minimal drug cocktail to the
patient and 2) modeling the activities of the targeted enzymes.

Job description:
In our laboratory, the post holder will develop a statistical software
application for modeling the enzymatic activities based on mass
spectrometry measures and patient characteristics (covariates) by using
population pharmacokinetics. Programming languages will include R and
C++. Firstly, (s)he will build and validate the statistical model on
experimental in vitro and in vivo data. Secondly, (s)he will participate
to the sampling strategy of a clinical trial aimed at collecting human
data. Finally, (s)he will apply the model to "personalized" dosage
prediction before administration of a new drug to a patient.

Profile:
Interested applicants should hold a Ph.D. in biostatistics or applied
mathematics (statistics, optimization) with experience in biological
data analysis, and be highly motivated by multidisciplinary team work
with biologists aiming at clinical application.

Our offer:
2-year contract (1 year renewable once).
Nature of the contract of employment: Fixed-term
Type of contract of employment: Private
Salary: net salary: about 2200 €/month, depending on experience.

Application:
Please send a detailed CV including the list of publications, a
motivation letter and two letters of recommendation to
Dr. Etienne Thévenot
etienne.thevenot_at_cea.fr
+33 (0)1 69 08 79 23
Data Modelling, Acquisition and Analysis Laboratory
CEA Saclay, DRT/LIST/DETECS/SSTM/L2MA, 91 191 Gif-sur-Yvette cedex, France

Note:
The candidate should not have presented his PhD thesis more than two
years before the starting date and should have a good record of
scientific publications.

--
Etienne Thévenot, Ph.D.
Laboratoire de Modélisation, Mesure et Analyse (Data Modelling, Acquisition and Analysis Laboratory)
Commissariat à l'Energie Atomique (French Atomic Energy Commission)
CEA Saclay, DRT/LIST/DETECS/SSTM/L2MA, bât. 516
91191 Gif-sur-Yvette cedex
France
Phone: +33 (0)1 69 08 79 23
Fax: +33 (0)1 69 08 60 30
E-mail : etienne.thevenot_at_cea.fr


Received on Mon Jul 16 2007 - 09:43:19 EDT